| 脳神経科学統合プログラム | 文部科学省 | D | 補助金等交付 | 29.8億円 |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | D | その他 | 19.6億円 |
| 生命科学・創薬研究支援基盤事業 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 13.4億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | C | その他 | 11.9億円 |
| 安全保障技術研究推進制度 | 防衛省 | H | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 8.0億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | G | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 6.7億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | K | 随意契約（その他） | 2.7億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | J | 随意契約（その他） | 2.1億円 |
| 革新的先端研究開発支援事業 | 文部科学省 | D | その他 | 2.1億円 |
| 研究開発とSociety5.0との橋渡しプログラム（BRIDGE） | 内閣府 | H | 随意契約（その他） | 2.0億円 |
| 研究開発とSociety5.0との橋渡しプログラム（BRIDGE） | 内閣府 | T | 随意契約（その他） | 2.0億円 |
| 新産業創出等研究開発推進事業費補助（東日本大震災復興特別会計） | 復興庁 | C | 随意契約（その他） | 1.8億円 |
| 次世代がん医療加速化研究事業 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 1.7億円 |
| 省エネ半導体関連開発事業（うち高効率・高速処理を可能とする次世代コンピューティングの技術開発事業） | 経済産業省 | C | 随意契約（公募） 2者 落札率50 | 1.7億円 |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | F | その他 | 1.5億円 |
| スマートバイオ創薬等研究支援事業 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 1.4億円 |
| 光・量子飛躍フラッグシッププログラム（Q-LEAP) | 文部科学省 | C | 随意契約（その他） | 1.4億円 |
| 脳神経科学統合プログラム | 文部科学省 | F | その他 | 1.4億円 |
| ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム（B-cure） | 文部科学省 | D | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 1.1億円 |
| 先端研究基盤共用促進事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（企画競争） 9者 落札率100 | 1.0億円 |
| 革新的先端研究開発支援事業 | 文部科学省 | E | その他 | 0.99億円 |
| 医療・健康推進事業（うち次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業） | 経済産業省 | C | 随意契約（企画競争） 4者 落札率25 | 0.96億円 |
| 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | C | その他 | 0.94億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | F | 補助金等交付 | 0.89億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | N | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.82億円 |
| 再生・細胞医療・遺伝子治療実現加速化プログラム | 文部科学省 | F | その他 | 0.72億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | I | 随意契約（その他） | 0.52億円 |
| データ創出・活用型マテリアル研究開発プロジェクト | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.47億円 |
| 安全保障技術研究推進制度 | 防衛省 | J | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 0.42億円 |
| AI等の活用を推進する研究データエコシステム構築事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.40億円 |
| 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.40億円 |
| Society5.0実現化研究拠点支援事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.28億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | M | 補助金等交付 | 0.26億円 |
| プラスチック有効利用高度化事業 | 経済産業省 | F | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.21億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 0.15億円 |
| 医療分野国際科学技術共同研究開発推進事業 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 0.06億円 |
| IoT社会実現に向けた次世代人工知能・センシング等中核技術開発 | 経済産業省 | G | 随意契約（企画競争） 19者 落札率100 | 0.06億円 |
| 医療・健康推進事業（うち再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業） | 経済産業省 | E | 随意契約（その他） | 0.05億円 |
| イノベーション創出のためのフロンティア育成・基盤構築事業（うちフロンティア育成・懸賞金型事業） | 経済産業省 | E | その他 | 0.05億円 |
| 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 文部科学省 | H | 随意契約（その他） | 0.05億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | F | 随意契約（その他） | 0.04億円 |
| イノベーション創出のためのフロンティア育成・基盤構築事業（うちフロンティア育成・懸賞金型事業） | 経済産業省 | G | その他 | 0.03億円 |
| 地域資源循環を通じた脱炭素化に向けた革新的触媒技術の開発・実証事業（文部科学省連携事業） | 環境省 | D | その他 | 0.02億円 |
| IoT社会実現に向けた次世代人工知能・センシング等中核技術開発 | 経済産業省 | D | 随意契約（企画競争） 40者 落札率100 | 0.00億円 |