| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | D | その他 | 35.4億円 |
| 再生・細胞医療・遺伝子治療実現加速化プログラム | 文部科学省 | D | その他 | 24.9億円 |
| 電気自動車用革新型蓄電池技術開発 | 経済産業省 | F | その他 | 11.2億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（医薬品プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 10.4億円 |
| 革新的先端研究開発支援事業 | 文部科学省 | D | その他 | 9.8億円 |
| 脳神経科学統合プログラム | 文部科学省 | F | その他 | 6.6億円 |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | C | その他 | 5.7億円 |
| 福島国際研究教育機構関連事業 | 復興庁 | D | 随意契約（その他） | 5.0億円 |
| オープンアクセス加速化事業 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 4.9億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（データ利活用・ライフコースプロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 4.1億円 |
| 脳神経科学統合プログラム | 文部科学省 | D | 補助金等交付 | 3.5億円 |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | F | その他 | 3.4億円 |
| 光・量子飛躍フラッグシッププログラム（Q-LEAP) | 文部科学省 | C | 随意契約（その他） | 3.4億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（再生・細胞医療・遺伝子治療プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 3.3億円 |
| 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | C | その他 | 2.7億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（感染症プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 2.6億円 |
| 次世代がん医療加速化研究事業 | 文部科学省 | C | 随意契約（その他） | 2.6億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | F | 随意契約（その他） | 2.6億円 |
| キャリア形成プログラム等運用支援事業等 | 厚生労働省 | B | 補助金等交付 | 1.8億円 |
| マテリアル先端リサーチインフラ | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 1.8億円 |
| 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | E | その他 | 1.7億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（シーズ開発・基礎研究プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | C | 補助金等交付 | 1.6億円 |
| 「デコ活」（脱炭素につながる新しい豊かな暮らしを創る国民運動）推進事業 | 環境省 | E | 随意契約（その他） | 1.5億円 |
| 革新的な省CO2実現のための部材や素材の社会実装・普及展開加速化事業 | 環境省 | B | 一般競争契約（総合評価） 1者 落札率100 | 1.4億円 |
| 再生・細胞医療・遺伝子治療実現加速化プログラム | 文部科学省 | F | その他 | 1.3億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | I | 随意契約（その他） | 1.3億円 |
| 生命科学・創薬研究支援基盤事業 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 1.3億円 |
| 橋渡し研究プログラム | 文部科学省 | C | 補助金等交付 | 1.3億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（シーズ開発・基礎研究プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 1.1億円 |
| 水素社会実現に向けた革新的燃料電池技術等の活用のための研究開発事業 | 経済産業省 | B | 随意契約（企画競争） 71者 落札率97 | 1.1億円 |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | B | その他 | 1.0億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（医療機器・ヘルスケアプロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 1.0億円 |
| 医療・介護・健康データ利活用基盤高度化事業（医療研究開発推進事業費補助金） | 総務省 | C | その他 | 1.0億円 |
| 気候変動適応戦略イニシアチブ | 文部科学省 | F | 随意契約（その他） | 1.0億円 |
| 戦略的イノベーション創造プログラム（エネルギー分野、次世代インフラ分野及び地域資源分野） | 内閣府 | W | 随意契約（企画競争） 36者 | 0.96億円 |
| がん診療連携拠点病院機能強化事業等 | 厚生労働省 | C | 補助金等交付 | 0.91億円 |
| 革新的先端研究開発支援事業 | 文部科学省 | E | その他 | 0.84億円 |
| 地震調査研究推進本部 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.82億円 |
| 医療・健康推進事業（うち予防・健康づくりの社会実装に向けた研究開発基盤整備事業） | 経済産業省 | K | 随意契約（公募） | 0.71億円 |
| エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 経済産業省 | D | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.68億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | F | 補助金等交付 | 0.67億円 |
| 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 文部科学省 | I | 随意契約（その他） | 0.63億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（医療機器・ヘルスケアプロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | C | 補助金等交付 | 0.59億円 |
| 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.56億円 |
| 脱炭素社会実現に向けた省エネルギー技術の研究開発・社会実装促進プログラム | 経済産業省 | C | その他 | 0.55億円 |
| 医療・健康推進事業（うち再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業） | 経済産業省 | B | 随意契約（企画競争） 22者 落札率36.3 | 0.50億円 |
| 保健衛生施設等施設・設備整備費補助金／（保健衛生施設等災害復旧費補助金含む） | 厚生労働省 | E | 補助金等交付 | 0.49億円 |
| 橋渡し研究プログラム | 文部科学省 | E | 随意契約（公募） 1者 落札率0 | 0.47億円 |
| カーボンリサイクル実現を加速するバイオ由来製品生産技術の開発事業 | 経済産業省 | E | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.45億円 |
| 新試験研究炉の開発・整備 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.41億円 |
| 次世代蓄電池・材料評価技術開発事業 | 経済産業省 | C | その他 | 0.40億円 |
| IoT社会実現に向けた次世代人工知能・センシング等中核技術開発 | 経済産業省 | C | 随意契約（企画競争） 40者 落札率100 | 0.39億円 |
| 先端計算科学等を活用した新規機能性材料合成・製造プロセス開発事業 | 経済産業省 | F | その他 | 0.37億円 |
| スマートバイオ創薬等研究支援事業 | 文部科学省 | E | 随意契約（その他） | 0.36億円 |
| 医療機器等における先進的研究開発・開発体制強靱化事業 | 経済産業省 | D | その他 | 0.36億円 |
| イノベーション創出のためのフロンティア育成・基盤構築事業（うち官民による若手研究者発掘支援事業） | 経済産業省 | C | 補助金等交付 | 0.33億円 |
| 水素社会推進に向けた先導的な技術開発・実証事業（うち競争的な水素等サプライチェーン構築に向けた技術開発事業） | 経済産業省 | F | その他 | 0.33億円 |
| エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 経済産業省 | E | 随意契約（企画競争） | 0.30億円 |
| 産業DXのためのデジタルインフラ整備事業 | 経済産業省 | H | 随意契約（その他） | 0.30億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | M | 随意契約（その他） | 0.28億円 |
| 医療・健康推進事業（うち予防・健康づくりの社会実装に向けた研究開発基盤整備事業） | 経済産業省 | B | 随意契約（公募） 9者 落札率33 | 0.26億円 |
| IoT社会実現に向けた次世代人工知能・センシング等中核技術開発 | 経済産業省 | F | 随意契約（企画競争） 40者 落札率100 | 0.25億円 |
| 障害のある学生の修学・就職支援促進事業 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 0.25億円 |
| 地震防災研究戦略プロジェクト | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.21億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | J | 随意契約（その他） | 0.20億円 |
| 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | B | その他 | 0.20億円 |
| スタートアップ支援事業（うち次世代ヘルステック・スタートアップ育成支援事業） | 経済産業省 | C | 補助金等交付 | 0.20億円 |
| 成長志向型の資源自律経済加速化事業（うち資源自律経済システム開発促進事業） | 経済産業省 | D | 補助金等交付 | 0.20億円 |
| イノベーション創出のためのフロンティア育成・基盤構築事業（うち官民による若手研究者発掘支援事業） | 経済産業省 | G | 補助金等交付 | 0.19億円 |
| 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 文部科学省 | H | 随意契約（その他） | 0.17億円 |
| カーボンリサイクル・次世代火力発電の技術開発等事業 | 経済産業省 | F | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.16億円 |
| カーボンリサイクル・次世代火力発電の技術開発等事業 | 経済産業省 | G | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.12億円 |
| 革新的パワーエレクトロニクス創出基盤技術研究開発事業 | 文部科学省 | H | その他 | 0.11億円 |
| カーボンリサイクル・次世代火力発電の技術開発等事業 | 経済産業省 | E | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.11億円 |
| 宇宙・航空科学技術推進の調整に必要な経費 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.10億円 |
| 航空機モニタリング等の運用・高度化事業 | 原子力規制委員会 | B | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 0.10億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | G | 随意契約（その他） | 0.10億円 |
| 先端研究基盤共用促進事業 | 文部科学省 | E | 随意契約（企画競争） | 0.10億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 0.09億円 |
| エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 経済産業省 | H | 随意契約（企画競争） 2者 落札率100 | 0.09億円 |
| 河川改修事業 | 国土交通省 | I | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 0.08億円 |
| 次世代X-nics半導体創生拠点形成事業 | 文部科学省 | E | その他 | 0.08億円 |
| 卓越研究員事業 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 0.08億円 |
| 教育データサイエンス推進事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（企画競争） 1者 | 0.08億円 |
| 放射性廃棄物共通技術調査等委託費 | 経済産業省 | C | 随意契約（その他） | 0.08億円 |
| 食品健康影響評価技術の研究に必要な経費 | 内閣府 | Q | 随意契約（公募） 8者 落札率100 | 0.07億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | F | 随意契約（その他） | 0.07億円 |
| 自動車リサイクルにおける再生材利用拡大に向けた産官学連携推進事業 | 環境省 | C | その他 | 0.07億円 |
| 新エネルギー等のシーズ発掘・事業化に向けた技術研究開発事業 | 経済産業省 | C | 補助金等交付 | 0.07億円 |
| 医療機器等における先進的研究開発・開発体制強靱化事業 | 経済産業省 | G | その他 | 0.07億円 |
| 新たな連携研究スキームによる研究（農林水産政策研究調査委託費） | 農林水産省 | E | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 0.07億円 |
| 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 経済産業省 | F | 随意契約（公募） 1者 | 0.07億円 |
| 次世代燃料の生産・利用技術開発等事業 | 経済産業省 | H | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 0.06億円 |
| 統計エキスパート人材育成プロジェクト | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.05億円 |
| 医療・健康推進事業（うち再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業） | 経済産業省 | E | 随意契約（その他） | 0.05億円 |
| 新興・再興感染症研究基盤創生事業 | 文部科学省 | E | 随意契約（その他） | 0.05億円 |
| 宇宙産業技術情報基盤整備研究開発事業（SERVISプロジェクト） | 経済産業省 | B | 随意契約（その他） | 0.05億円 |
| 北極域研究推進プロジェクト | 文部科学省 | F | 随意契約（その他） | 0.04億円 |
| 統計情報提供事業 | 総務省 | H | 随意契約（その他） | 0.04億円 |
| カーボンプライシング調査事業 | 環境省 | G | 一般競争契約（総合評価） 1者 落札率58.8 | 0.03億円 |
| 省エネ半導体関連開発事業（うち高効率・高速処理を可能とする次世代コンピューティングの技術開発事業） | 経済産業省 | G | その他 | 0.03億円 |
| 宇宙太陽光発電における無線送受電技術の高効率化に向けた研究開発事業委託費 | 経済産業省 | C | 随意契約（その他） | 0.02億円 |
| 地震防災研究戦略プロジェクト | 文部科学省 | L | 随意契約（その他） | 0.02億円 |
| 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 文部科学省 | T | 随意契約（その他） | 0.01億円 |
| カーボンリサイクル実現を加速するバイオ由来製品生産技術の開発事業 | 経済産業省 | J | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.01億円 |
| 水資源開発事業 | 国土交通省 | H | 随意契約（その他） | 0.01億円 |
| 気候変動適応戦略イニシアチブ | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.00億円 |