| 地域における拠点形成等の構築に向けた取組の推進 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 12.0億円 |
| 地域の中核大学等のインキュベーション・産学融合拠点の整備 | 経済産業省 | B | 補助金等交付 | 7.3億円 |
| 医療・健康推進事業（うち次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業） | 経済産業省 | B | 随意契約（企画競争） 6者 落札率50 | 3.4億円 |
| オープンアクセス加速化事業 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 2.9億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（シーズ開発・基礎研究プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | C | 補助金等交付 | 1.6億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | J | 随意契約（その他） | 1.5億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | G | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 1.4億円 |
| 新興・再興感染症研究基盤創生事業 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 0.89億円 |
| カーボンリサイクル実現を加速するバイオ由来製品生産技術の開発事業 | 経済産業省 | E | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.71億円 |
| イノベーション創出のためのフロンティア育成・基盤構築事業（うち官民による若手研究者発掘支援事業） | 経済産業省 | C | 補助金等交付 | 0.49億円 |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | E | その他 | 0.48億円 |
| 医療・健康推進事業（うち予防・健康づくりの社会実装に向けた研究開発基盤整備事業） | 経済産業省 | I | 随意契約（公募） | 0.39億円 |
| 成長志向型の資源自律経済加速化事業（うち資源自律経済システム開発促進事業） | 経済産業省 | D | 補助金等交付 | 0.35億円 |
| 医療・健康推進事業（うち再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業） | 経済産業省 | F | 随意契約（その他） | 0.34億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | M | 随意契約（その他） | 0.30億円 |
| 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | B | その他 | 0.26億円 |
| 5G等の活用による製造業のダイナミック・ケイパビリティ強化に向けた研究開発事業 | 経済産業省 | D | その他 | 0.26億円 |
| 医療機器等研究成果展開事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.26億円 |
| 医療・健康推進事業（うち再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業） | 経済産業省 | E | 随意契約（その他） | 0.24億円 |
| カーボンリサイクル実現を加速するバイオ由来製品生産技術の開発事業 | 経済産業省 | J | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.20億円 |
| グリーン冷媒・機器開発事業 | 経済産業省 | B | 随意契約（公募） | 0.19億円 |
| 北極域研究推進プロジェクト | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 0.17億円 |
| 次世代のがんプロフェッショナル養成プラン | 文部科学省 | B | その他 | 0.14億円 |
| 医薬品等国際化対策事業 | 厚生労働省 | B | 補助金等交付 | 0.14億円 |
| 市民参加による海洋総合知創出手法構築プロジェクト | 文部科学省 | B | 随意契約（企画競争） 4者 落札率100 | 0.10億円 |
| 革新的ロボット研究開発等基盤構築事業 | 経済産業省 | J | その他 | 0.10億円 |
| 先端計算科学等を活用した新規機能性材料合成・製造プロセス開発事業 | 経済産業省 | F | その他 | 0.09億円 |
| 医療分野国際科学技術共同研究開発推進事業 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 0.06億円 |
| 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 文部科学省 | H | 随意契約（その他） | 0.06億円 |
| エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 経済産業省 | I | 随意契約（企画競争） | 0.05億円 |
| プラスチック有効利用高度化事業 | 経済産業省 | C | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.04億円 |
| 学校卒業後における障害者の学びの支援に関する実践研究事業 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 0.03億円 |
| 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 文部科学省 | O | 随意契約（その他） | 0.01億円 |
| 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 文部科学省 | T | 随意契約（その他） | 0.00億円 |