| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | D | その他 | 26.4億円 |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | C | その他 | 8.4億円 |
| 革新的先端研究開発支援事業 | 文部科学省 | D | その他 | 7.8億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（医薬品プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 5.0億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | J | 随意契約（その他） | 4.2億円 |
| 次世代X-nics半導体創生拠点形成事業 | 文部科学省 | C | 随意契約（企画競争） 9者 落札率100 | 3.9億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（感染症プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 3.3億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | G | 随意契約（その他） | 3.2億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | F | 随意契約（その他） | 3.1億円 |
| 再生・細胞医療・遺伝子治療実現加速化プログラム | 文部科学省 | D | その他 | 2.7億円 |
| 水素社会実現に向けた革新的燃料電池技術等の活用のための研究開発事業 | 経済産業省 | B | 随意契約（企画競争） 24者 落札率100 | 2.7億円 |
| 電気自動車用革新型蓄電池技術開発 | 経済産業省 | F | その他 | 2.6億円 |
| 科学技術イノベーション創造推進費（健康・医療分野） | 内閣府 | K | 随意契約（その他） | 2.3億円 |
| 国立研究開発法人宇宙航空研究開発機構運営費交付金に必要な経費 | 文部科学省 | C | 随意契約（企画競争） 1者 | 2.0億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（再生・細胞医療・遺伝子治療プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | D | 随意契約（その他） | 1.7億円 |
| 脳神経科学統合プログラム | 文部科学省 | D | 補助金等交付 | 1.7億円 |
| 次世代がん医療加速化研究事業 | 文部科学省 | C | 随意契約（その他） | 1.4億円 |
| 新興・再興感染症研究基盤創生事業 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 1.4億円 |
| 省エネ半導体関連開発事業（うち高効率・高速処理を可能とする次世代コンピューティングの技術開発事業） | 経済産業省 | G | その他 | 1.2億円 |
| 戦略的イノベーション創造プログラム（エネルギー分野、次世代インフラ分野及び地域資源分野） | 内閣府 | Y | 随意契約（企画競争） 10者 | 1.0億円 |
| 革新的先端研究開発支援事業 | 文部科学省 | E | その他 | 0.92億円 |
| 医療・健康推進事業（うち次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業） | 経済産業省 | C | 随意契約（企画競争） 4者 落札率25 | 0.90億円 |
| 生命科学・創薬研究支援基盤事業 | 文部科学省 | B | 補助金等交付 | 0.80億円 |
| 医療機器等研究成果展開事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.78億円 |
| 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 文部科学省 | B | 随意契約（企画競争） 15者 | 0.78億円 |
| 医療研究開発推進事業費補助金（医療機器・ヘルスケアプロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 厚生労働省 | C | 補助金等交付 | 0.77億円 |
| 再生・細胞医療・遺伝子治療実現加速化プログラム | 文部科学省 | F | その他 | 0.75億円 |
| 脳神経科学統合プログラム | 文部科学省 | F | その他 | 0.67億円 |
| エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 経済産業省 | D | 随意契約（企画競争） 3者 落札率100 | 0.65億円 |
| 次世代蓄電池・材料評価技術開発事業 | 経済産業省 | C | その他 | 0.65億円 |
| 医療機器等における先進的研究開発・開発体制強靱化事業 | 経済産業省 | D | その他 | 0.62億円 |
| IoT社会実現に向けた次世代人工知能・センシング等中核技術開発 | 経済産業省 | C | 随意契約（企画競争） 40者 落札率100 | 0.54億円 |
| 成長志向型の資源自律経済加速化事業（うち資源自律経済システム開発促進事業） | 経済産業省 | F | 補助金等交付 | 0.48億円 |
| 共同利用・共同研究システム形成事業 | 文部科学省 | C | 補助金等交付 | 0.45億円 |
| マテリアル先端リサーチインフラ | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 0.41億円 |
| 省エネ半導体関連開発事業（うち省エネAI半導体及びシステムに関する技術開発事業） | 経済産業省 | D | その他 | 0.33億円 |
| イノベーション創出のためのフロンティア育成・基盤構築事業（うち官民による若手研究者発掘支援事業） | 経済産業省 | C | 補助金等交付 | 0.32億円 |
| 地方の若手人材発掘育成支援事業（AKATSUKIプロジェクト） | 経済産業省 | B | 補助金等交付 | 0.30億円 |
| 医療・健康推進事業（うち予防・健康づくりの社会実装に向けた研究開発基盤整備事業） | 経済産業省 | F | 随意契約（公募） 23者 落札率8.7 | 0.30億円 |
| 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 文部科学省 | O | 随意契約（その他） | 0.29億円 |
| 医療・健康推進事業（うち予防・健康づくりの社会実装に向けた研究開発基盤整備事業） | 経済産業省 | B | 随意契約（公募） 22者 落札率9 | 0.28億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.27億円 |
| スマートバイオ創薬等研究支援事業 | 文部科学省 | E | 随意契約（その他） | 0.26億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | F | 補助金等交付 | 0.26億円 |
| 高校生等への修学支援 | 文部科学省 | C | 補助金等交付 | 0.26億円 |
| 福島国際研究教育機構関連事業 | 復興庁 | C | 随意契約（その他） | 0.26億円 |
| データ創出・活用型マテリアル研究開発プロジェクト | 文部科学省 | B | 随意契約（その他） | 0.25億円 |
| エネルギー・環境分野の官民による若手研究者発掘支援事業 | 経済産業省 | C | 補助金等交付 | 0.25億円 |
| 再生可能エネルギーの大量導入に向けた次世代型の電力制御技術開発事業 | 経済産業省 | B | 随意契約（企画競争） 8者 落札率100 | 0.21億円 |
| 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 文部科学省 | C | 随意契約（その他） | 0.20億円 |
| 新興・再興感染症研究基盤創生事業 | 文部科学省 | F | 随意契約（その他） | 0.18億円 |
| 革新的ロボット研究開発等基盤構築事業 | 経済産業省 | J | その他 | 0.17億円 |
| 使用済MOX燃料の再処理技術等に係る研究開発事業 | 経済産業省 | B | 随意契約（その他） | 0.17億円 |
| 次世代燃料安定供給のためのトランジション促進事業 | 経済産業省 | D | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 0.17億円 |
| 量子・古典ハイブリッド技術のサイバー・フィジカル開発事業 | 経済産業省 | C | その他 | 0.16億円 |
| 次世代航空機開発・次世代空モビリティ社会実装に向けた基盤技術開発事業（うち次世代空モビリティの社会実装に向けた実現プロジェクト） | 経済産業省 | N | その他 | 0.14億円 |
| ポストコロナ時代の医療人材養成拠点形成事業 | 文部科学省 | B | その他 | 0.14億円 |
| 先端計算科学等を活用した新規機能性材料合成・製造プロセス開発事業 | 経済産業省 | E | その他 | 0.13億円 |
| 「デコ活」（脱炭素につながる新しい豊かな暮らしを創る国民運動）推進事業 | 環境省 | F | 随意契約（その他） | 0.13億円 |
| カーボンリサイクル・次世代火力発電の技術開発等事業 | 経済産業省 | E | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.13億円 |
| プラスチック有効利用高度化事業 | 経済産業省 | C | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.12億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | D | 随意契約（その他） | 0.11億円 |
| 医療・健康推進事業（うち再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業） | 経済産業省 | E | 随意契約（その他） | 0.10億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | E | 随意契約（その他） | 0.10億円 |
| 太陽光発電の導入可能量拡大等に向けた技術開発事業 | 経済産業省 | F | 随意契約（公募） 11者 落札率100 | 0.08億円 |
| カーボンリサイクル・次世代火力発電の技術開発等事業 | 経済産業省 | B | 随意契約（企画競争） 3者 落札率100 | 0.08億円 |
| 医療機器等における先進的研究開発・開発体制強靱化事業 | 経済産業省 | G | 随意契約（企画競争） 31者 落札率83.3 | 0.08億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | N | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.07億円 |
| 木質バイオマス燃料等の安定的・効率的な供給・利用システム構築支援事業 | 経済産業省 | E | 補助金等交付 | 0.07億円 |
| 次世代燃料の生産・利用技術開発等事業 | 経済産業省 | H | 随意契約（公募） 1者 落札率100 | 0.06億円 |
| エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 経済産業省 | H | 随意契約（企画競争） 2者 落札率100 | 0.05億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | J | 随意契約（その他） | 0.05億円 |
| エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 経済産業省 | J | 随意契約（企画競争） | 0.05億円 |
| 原子力システム研究開発委託費 | 文部科学省 | F | 随意契約（その他） | 0.04億円 |
| 放射性廃棄物共通技術調査等委託費 | 経済産業省 | C | 随意契約（その他） | 0.04億円 |
| 革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ（ＨＰＣＩ）の構築 | 文部科学省 | M | 随意契約（その他） | 0.03億円 |
| エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 経済産業省 | I | 随意契約（企画競争） 16者 落札率100 | 0.03億円 |
| 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 文部科学省 | H | 随意契約（その他） | 0.03億円 |
| 次世代X-nics半導体創生拠点形成事業 | 文部科学省 | E | その他 | 0.03億円 |
| カーボンリサイクル実現を加速するバイオ由来製品生産技術の開発事業 | 経済産業省 | J | 随意契約（企画競争） 1者 落札率100 | 0.03億円 |
| 使用済MOX燃料の再処理技術等に係る研究開発事業 | 経済産業省 | H | 随意契約（その他） | 0.02億円 |
| 地震防災研究戦略プロジェクト | 文部科学省 | J | 随意契約（その他） | 0.01億円 |
| 革新的パワーエレクトロニクス創出基盤技術研究開発事業 | 文部科学省 | I | その他 | 0.01億円 |
| 難病特別対策推進事業 | 厚生労働省 | B | 補助金等交付 | 0.01億円 |
| 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 文部科学省 | T | 随意契約（その他） | 0.01億円 |