| 農業競争力強化基盤整備事業 | 農林水産省 | その他 | 22.9億円 |
| TPP等関連農業農村整備事業 | 農林水産省 | その他 | 21.4億円 |
| 砂防事業 | 国土交通省 | その他 | 16.0億円 |
| なりわい再建支援事業（令和6年能登半島地震等） | 経済産業省 | 補助金等交付 | 12.5億円 |
| デジタル田園都市国家構想交付金（地方創生推進タイプ）＜（旧）地方創生推進交付金＞ | 内閣府 | 補助金等交付 | 11.5億円 |
| 観光復興に向けた支援（北陸応援割） | 観光庁 | 補助金等交付 | 10.0億円 |
| 林業・木材産業国際競争力強化総合対策 | 林野庁 | 補助金等交付 | 8.7億円 |
| 山林施設災害復旧等事業 | 林野庁 | 補助金等交付 | 8.6億円 |
| ダムの維持管理事業 | 国土交通省 | その他 | 7.5億円 |
| 災害救助等に要する経費 | 内閣府 | 補助金等交付 | 4.3億円 |
| 水産業競争力強化緊急事業 | 水産庁 | 補助金等交付 | 3.9億円 |
| 港湾関係災害復旧事業費 | 国土交通省 | 補助金等交付 | 3.5億円 |
| 公立学校施設災害復旧費 | 文部科学省 | その他 | 2.8億円 |
| 浜の活力再生・成長促進交付金 | 水産庁 | 補助金等交付 | 2.3億円 |
| 漁港関係災害復旧等事業 | 水産庁 | 補助金等交付 | 2.1億円 |
| 地すべり対策事業 | 国土交通省 | その他 | 2.0億円 |
| 農地利用効率化等支援交付金 | 農林水産省 | 補助金等交付 | 1.4億円 |
| 一般空港等整備事業（補助） | 国土交通省 | 補助金等交付 | 1.3億円 |
| 災害等廃棄物処理事業費補助金 | 環境省 | 補助金等交付 | 1.3億円 |
| 令和６年能登半島地震被災者のための共同利用漁船等復旧支援対策事業 | 水産庁 | 補助金等交付 | 1.1億円 |
| 農林水産業共同利用施設災害復旧事業 | 農林水産省 | 補助金等交付 | 1.1億円 |
| 花粉の少ない森林への転換促進緊急総合対策 | 林野庁 | 補助金等交付 | 1.1億円 |
| 職業能力開発校施設整備費等補助金 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 1.0億円 |
| 担い手確保・経営強化支援事業 | 農林水産省 | 補助金等交付 | 0.94億円 |
| 砂防事業 | 国土交通省 | 随意契約（その他） | 0.50億円 |
| 保健衛生施設等施設・設備整備費補助金／（保健衛生施設等災害復旧費補助金含む） | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.41億円 |
| 母子父子寡婦福祉貸付金 | こども家庭庁 | その他 | 0.41億円 |
| 令和６年能登半島地震に係る医療保険者等への財政支援 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.37億円 |
| 地域文化共創基盤の構築 | 文化庁 | 補助金等交付 | 0.37億円 |
| 文化拠点機能強化・文化観光推進プラン | 文化庁 | 補助金等交付 | 0.31億円 |
| 地域医療提供体制データ分析チーム構築支援事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.30億円 |
| イタイイタイ病等に関する研究・調査事業 | 環境省 | 随意契約（その他） | 0.24億円 |
| ＮＩＣＵ等からの退院の促進 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.23億円 |
| 警察施設（補助施設）の整備等（災害復旧） | 警察庁 | 補助金等交付 | 0.22億円 |
| 新規就農者育成総合対策のうち誘致環境の整備、農業教育の高度化等への支援（令和7年度補正：新規就農者確保緊急円滑化対策のうち農業教育環境整備事業及び農業の魅力発信支援事業） | 農林水産省 | 補助金等交付 | 0.18億円 |
| 私立高等学校産業教育施設整備費補助 | 文部科学省 | その他 | 0.17億円 |
| 花粉の少ない森林への転換促進緊急総合対策 | 林野庁 | 補助金等交付 | 0.15億円 |
| 集落営農連携促進等事業 | 農林水産省 | 補助金等交付 | 0.14億円 |
| 女性に対する暴力の根絶に向けた取組に必要な経費 | 内閣府 | 補助金等交付 | 0.14億円 |
| 社会福祉施設等施設整備（その他） | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.12億円 |
| いじめ対策・不登校支援等総合推進事業 | 文部科学省 | 補助金等交付 | 0.12億円 |
| 後発医薬品品質確保対策事業 | 厚生労働省 | その他 | 0.12億円 |
| 地域の持続的発展のための中小商業者等の機能活性化事業 | 経済産業省 | 補助金等交付 | 0.10億円 |
| 河川等災害復旧事業 | 国土交通省 | 補助金等交付 | 0.10億円 |
| 新ロードマップに基づく資源管理等高度化促進事業（新たな資源管理システム構築促進事業）（令和７年度補正：海洋環境の変化に対応した資源管理体制の整備） | 水産庁 | 随意契約（公募） 1者 落札率0 | 0.09億円 |
| 災害救助等に要する経費 | 内閣府 | 補助金等交付 | 0.09億円 |
| 地域の持続的発展のための中小商業者等の機能活性化事業 | 経済産業省 | 補助金等交付 | 0.08億円 |
| 地域の持続的発展のための中小商業者等の機能活性化事業 | 経済産業省 | 補助金等交付 | 0.07億円 |
| 児童福祉施設等災害復旧費 | こども家庭庁 | 補助金等交付 | 0.07億円 |
| 水産業競争力強化緊急事業 | 水産庁 | 補助金等交付 | 0.06億円 |
| 日本にゆかりのある方々と国内自治体との連携促進事業（旧：中南米日経社会と国内自治体との連携促進事業） | 総務省 | 随意契約（企画競争） 7者 落札率100 | 0.05億円 |
| 漁港機能増進事業 | 水産庁 | 補助金等交付 | 0.05億円 |
| 林業デジタル・イノベーション総合対策 | 林野庁 | 補助金等交付 | 0.05億円 |
| 災害救助等に要する経費 | 内閣府 | 補助金等交付 | 0.05億円 |
| 原子力・エネルギー教育支援事業交付金 | 文部科学省 | 補助金等交付 | 0.04億円 |
| 健康的な生活習慣づくり重点化事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.04億円 |
| 鳥獣保護管理対策費 | 環境省 | その他 | 0.04億円 |
| 宗務行政の推進 | 文化庁 | 補助金等交付 | 0.04億円 |
| 救急患者の受入体制の充実（統合補助金分） | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.04億円 |
| 保安林等整備管理費 | 林野庁 | 補助金等交付 | 0.03億円 |
| 中学校・高等学校スポーツ活動振興事業 | スポーツ庁 | 補助金等交付 | 0.03億円 |
| 障害福祉分野の介護テクノロジー導入支援事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.03億円 |
| 小児救急医療体制の充実 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.02億円 |
| 医療連携体制推進事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.02億円 |
| 社会福祉施設等災害復旧費補助金等 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.02億円 |
| 要介護認定適正化等事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.02億円 |
| 農林水産業共同利用施設災害復旧事業 | 農林水産省 | 補助金等交付 | 0.02億円 |
| 自治体こども計画策定支援事業 | こども家庭庁 | 補助金等交付 | 0.02億円 |
| 糖尿病の重症化・合併症の発症予防のための地域における診療連携体制推進に資する事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.02億円 |
| 慢性腎臓病（CKD)特別対策事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.01億円 |
| 感染症対策特別促進事業費 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.01億円 |
| 障害者就労支援等における生産活動の効率化に資するＩＣＴ機器等の導入事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.01億円 |
| 令和の日本型学校体育構築支援事業 | スポーツ庁 | 随意契約（企画競争） 46者 落札率100 | 0.01億円 |
| 農林水産業共同利用施設災害復旧事業 | 農林水産省 | その他 | 0.01億円 |
| 院内感染地域支援ネットワーク相談事業 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.01億円 |
| 社会福祉施設等設備災害復旧費補助金 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.01億円 |
| 旧軍人遺族等恩給進達事務事業 | 厚生労働省 | その他 | 0.01億円 |
| 災害時における医療提供体制の確保 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.01億円 |
| 医薬品等ＧＭＰ対策事業 | 厚生労働省 | その他 | 0.01億円 |
| 口腔保健推進事業費 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.01億円 |
| 医薬品国家検定事業 | 厚生労働省 | その他 | 0.01億円 |
| 一般空港等整備事業（補助） | 国土交通省 | 補助金等交付 | 0.00億円 |
| 森林・山村地域振興対策 | 林野庁 | 補助金等交付 | 0.00億円 |
| 学校保健の推進等 | 文部科学省 | その他 | 0.00億円 |
| 孤独・孤立対策推進経費 | 内閣府 | 補助金等交付 | 0.00億円 |
| 医薬品等ＧＭＰ対策事業 | 厚生労働省 | その他 | 0.00億円 |
| 動物用医薬品対策事業 | 農林水産省 | 随意契約（少額） | 0.00億円 |
| 高齢者医療制度円滑運営臨時特例交付金 | 厚生労働省 | 補助金等交付 | 0.00億円 |
| 児童保護災害臨時特例補助金 | こども家庭庁 | 補助金等交付 | 0.00億円 |
| 麻薬・覚醒剤等対策費 | 厚生労働省 | その他 | 0.00億円 |
| 地域児童福祉事業等調査 | こども家庭庁 | 随意契約（その他） | 0.00億円 |